干细胞与生殖医学研究组建立于2009年，致力于人类胚胎早期发育的遗传学及表观遗传学研究，围绕配子发生、胚胎发育、干细胞命运决定、干细胞治疗以及生殖医学疾病的发病机制等，建立了具有国际先进水平的研究平台。在国际上首次利用单细胞RNA-seq技术对人及其他哺乳动物胚胎着床前发育各阶段的转录调控网络进行了系统分析，揭示了人类和小鼠早期胚胎的遗传程序，证明了哺乳动物早期胚胎发育进化上的共性，研究成果发表在《Nature》上；进一步用单细胞技术解析了人植入窗口期胚胎滋养外胚层细胞的发育程序，鉴定出调控细胞分化的关键因子TBX3，为理解胚胎植入过程提供了重要依据，成果发表在《PLoS Biology》上；此外利用显微毛细吸管分离单细胞开发了新的测序方法scMT-seq，可以用来检测同一单细胞中的转录组、甲基化组和单核苷酸多态性信息，解析表观遗传学基因调控机制，成果发表在《Genome Biology》上；利用单细胞技术对心脏起博机制的相关研究成果相继发表在《Nature Communications》、《Protein & Cell》等高水平国际期刊上。系列研究成果多次获得国家级重大项目支持和多项荣誉。

     课题组十余年来已指导毕业博士研究生10名，硕士研究生9名，其中1人获得全国建模大赛二等奖，2人获得校级优秀毕业论文；课题组注重与其他实验室的交流，联合培养博士4名、硕士3名，其中1人获得国家留学基金委的资助在美国加州理工大学进行学术交流，1人前往丹麦哥本哈根大学学术交流等。