脑源性神经营养因子（BDNF）是参与神经可塑性和认知功能调控的关键因子。BDNF val66met基因多态性是人类存在的一个BDNF基因pro-domain的单氨基酸多态性（SNP），该多态性与活性依赖的BDNF的分泌及海马依赖的记忆缺陷有关，但其潜在的机制有待阐明。我们发现在模拟人类SNP的BDNF^Met/Met转基因小鼠中，海马部位BDNF的表达降低。海马CA1区的细胞数量减少，同时海马NR2a, 2b, GluR1, 2 及 GABA_ARb3 亚单位的mRNA表达上调。海马CA1区谷氨酸能的基本突触传递没有改变，而低频刺激诱导的LTD降低。BDNF能部分恢复损害的LTD。值得注意的是，在BDNF^Met/Met小鼠中，海马5-HT3受体表达下调，而5-HT2c受体的表达上调。而且，5-HT3受体激动剂能恢复BDNF^Met/Met小鼠海马中损害的LTD。以上结果提示BDNF val66met基因多态性通过下调5-HT3受体改变海马突触可塑性，该机制可能是导致Met携带者认知障碍的原因。